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diff --git a/drivers/pci/host/pci-rcar-gen2.c b/drivers/pci/host/pci-rcar-gen2.c
index fd3e3ab56509..4fe349dcaf59 100644
--- a/drivers/pci/host/pci-rcar-gen2.c
+++ b/drivers/pci/host/pci-rcar-gen2.c
@@ -15,6 +15,7 @@
 #include <linux/io.h>
 #include <linux/kernel.h>
 #include <linux/module.h>
+#include <linux/of_pci.h>
 #include <linux/pci.h>
 #include <linux/platform_device.h>
 #include <linux/pm_runtime.h>
@@ -180,8 +181,13 @@ static int rcar_pci_map_irq(const struct pci_dev *dev, u8 slot, u8 pin)
 {
         struct pci_sys_data *sys = dev->bus->sysdata;
         struct rcar_pci_priv *priv = sys->private_data;
+        int irq;
+
+        irq = of_irq_parse_and_map_pci(dev, slot, pin);
+        if (!irq)
+                irq = priv->irq;
 
-        return priv->irq;
+        return irq;
 }
 
 #ifdef CONFIG_PCI_DEBUG
diff --git a/drivers/pci/host/pci-tegra.c b/drivers/pci/host/pci-tegra.c
index 330f7e3a32dd..083cf37ca047 100644
--- a/drivers/pci/host/pci-tegra.c
+++ b/drivers/pci/host/pci-tegra.c
@@ -639,10 +639,15 @@ static int tegra_pcie_setup(int nr, struct pci_sys_data *sys)
 static int tegra_pcie_map_irq(const struct pci_dev *pdev, u8 slot, u8 pin)
 {
         struct tegra_pcie *pcie = sys_to_pcie(pdev->bus->sysdata);
+        int irq;
 
         tegra_cpuidle_pcie_irqs_in_use();
 
-        return pcie->irq;
+        irq = of_irq_parse_and_map_pci(pdev, slot, pin);
+        if (!irq)
+                irq = pcie->irq;
+
+        return irq;
 }
 
 static void tegra_pcie_add_bus(struct pci_bus *bus)
diff --git a/drivers/pci/host/pcie-designware.c b/drivers/pci/host/pcie-designware.c
index 509a29d84509..c4e373294476 100644
--- a/drivers/pci/host/pcie-designware.c
+++ b/drivers/pci/host/pcie-designware.c
@@ -17,6 +17,7 @@
 #include <linux/module.h>
 #include <linux/msi.h>
 #include <linux/of_address.h>
+#include <linux/of_pci.h>
 #include <linux/pci.h>
 #include <linux/pci_regs.h>
 #include <linux/types.h>
@@ -490,7 +491,7 @@ int __init dw_pcie_host_init(struct pcie_port *pp)
         dw_pci.nr_controllers = 1;
         dw_pci.private_data = (void **)&pp;
 
-        pci_common_init(&dw_pci);
+        pci_common_init_dev(pp->dev, &dw_pci);
         pci_assign_unassigned_resources();
 #ifdef CONFIG_PCI_DOMAINS
         dw_pci.domain++;
@@ -520,13 +521,13 @@ static void dw_pcie_prog_viewport_cfg1(struct pcie_port *pp, u32 busdev)
         dw_pcie_writel_rc(pp, PCIE_ATU_REGION_OUTBOUND | PCIE_ATU_REGION_INDEX1,
                           PCIE_ATU_VIEWPORT);
         dw_pcie_writel_rc(pp, PCIE_ATU_TYPE_CFG1, PCIE_ATU_CR1);
-        dw_pcie_writel_rc(pp, PCIE_ATU_ENABLE, PCIE_ATU_CR2);
         dw_pcie_writel_rc(pp, pp->cfg1_base, PCIE_ATU_LOWER_BASE);
         dw_pcie_writel_rc(pp, (pp->cfg1_base >> 32), PCIE_ATU_UPPER_BASE);
         dw_pcie_writel_rc(pp, pp->cfg1_base + pp->config.cfg1_size - 1,
                           PCIE_ATU_LIMIT);
         dw_pcie_writel_rc(pp, busdev, PCIE_ATU_LOWER_TARGET);
         dw_pcie_writel_rc(pp, 0, PCIE_ATU_UPPER_TARGET);
+        dw_pcie_writel_rc(pp, PCIE_ATU_ENABLE, PCIE_ATU_CR2);
 }
 
 static void dw_pcie_prog_viewport_mem_outbound(struct pcie_port *pp)
@@ -535,7 +536,6 @@ static void dw_pcie_prog_viewport_mem_outbound(struct pcie_port *pp)
         dw_pcie_writel_rc(pp, PCIE_ATU_REGION_OUTBOUND | PCIE_ATU_REGION_INDEX0,
                           PCIE_ATU_VIEWPORT);
         dw_pcie_writel_rc(pp, PCIE_ATU_TYPE_MEM, PCIE_ATU_CR1);
-        dw_pcie_writel_rc(pp, PCIE_ATU_ENABLE, PCIE_ATU_CR2);
         dw_pcie_writel_rc(pp, pp->mem_base, PCIE_ATU_LOWER_BASE);
         dw_pcie_writel_rc(pp, (pp->mem_base >> 32), PCIE_ATU_UPPER_BASE);
         dw_pcie_writel_rc(pp, pp->mem_base + pp->config.mem_size - 1,
@@ -543,6 +543,7 @@ static void dw_pcie_prog_viewport_mem_outbound(struct pcie_port *pp)
         dw_pcie_writel_rc(pp, pp->config.mem_bus_addr, PCIE_ATU_LOWER_TARGET);
         dw_pcie_writel_rc(pp, upper_32_bits(pp->config.mem_bus_addr),
                           PCIE_ATU_UPPER_TARGET);
+        dw_pcie_writel_rc(pp, PCIE_ATU_ENABLE, PCIE_ATU_CR2);
 }
 
 static void dw_pcie_prog_viewport_io_outbound(struct pcie_port *pp)
@@ -551,7 +552,6 @@ static void dw_pcie_prog_viewport_io_outbound(struct pcie_port *pp)
         dw_pcie_writel_rc(pp, PCIE_ATU_REGION_OUTBOUND | PCIE_ATU_REGION_INDEX1,
                           PCIE_ATU_VIEWPORT);
         dw_pcie_writel_rc(pp, PCIE_ATU_TYPE_IO, PCIE_ATU_CR1);
-        dw_pcie_writel_rc(pp, PCIE_ATU_ENABLE, PCIE_ATU_CR2);
         dw_pcie_writel_rc(pp, pp->io_base, PCIE_ATU_LOWER_BASE);
         dw_pcie_writel_rc(pp, (pp->io_base >> 32), PCIE_ATU_UPPER_BASE);
         dw_pcie_writel_rc(pp, pp->io_base + pp->config.io_size - 1,
@@ -559,6 +559,7 @@ static void dw_pcie_prog_viewport_io_outbound(struct pcie_port *pp)
         dw_pcie_writel_rc(pp, pp->config.io_bus_addr, PCIE_ATU_LOWER_TARGET);
         dw_pcie_writel_rc(pp, upper_32_bits(pp->config.io_bus_addr),
                           PCIE_ATU_UPPER_TARGET);
+        dw_pcie_writel_rc(pp, PCIE_ATU_ENABLE, PCIE_ATU_CR2);
 }
 
 static int dw_pcie_rd_other_conf(struct pcie_port *pp, struct pci_bus *bus,
@@ -723,7 +724,7 @@ static struct pci_bus *dw_pcie_scan_bus(int nr, struct pci_sys_data *sys)
 
         if (pp) {
                 pp->root_bus_nr = sys->busnr;
-                bus = pci_scan_root_bus(NULL, sys->busnr, &dw_pcie_ops,
+                bus = pci_scan_root_bus(pp->dev, sys->busnr, &dw_pcie_ops,
                                         sys, &sys->resources);
         } else {
                 bus = NULL;
@@ -736,8 +737,13 @@ static struct pci_bus *dw_pcie_scan_bus(int nr, struct pci_sys_data *sys)
 static int dw_pcie_map_irq(const struct pci_dev *dev, u8 slot, u8 pin)
 {
         struct pcie_port *pp = sys_to_pcie(dev->bus->sysdata);
+        int irq;
+
+        irq = of_irq_parse_and_map_pci(dev, slot, pin);
+        if (!irq)
+                irq = pp->irq;
 
-        return pp->irq;
+        return irq;
 }
 
 static void dw_pcie_add_bus(struct pci_bus *bus)
@@ -764,7 +770,7 @@ void dw_pcie_setup_rc(struct pcie_port *pp)
         u32 membase;
         u32 memlimit;
 
-        /* set the number of lines as 4 */
+        /* set the number of lanes */
         dw_pcie_readl_rc(pp, PCIE_PORT_LINK_CONTROL, &val);
         val &= ~PORT_LINK_MODE_MASK;
         switch (pp->lanes) {